Os Macroinvertebrados aquáticos (grandes invertebrados) constituem uma importante fonte alimentar para os peixes, são valiosos indicadores da degradação ambiental. Encontram-se distribuídos por todos os ambientes aquáticos e apresentam uma grande variedade de formas e ciclos de vida. Um dos principais grupos taxonómicos a viver no meio aquático são os Crustáceos, como o Lagostim-vermelho (Procambarus clarkii), também conhecido por Lagostim-do-louisiana, espécie da América do Norte introduzida pelo Homem em muitos ecossistemas de água doce é responsável pela destruição de campos de arroz e pela predação e competição com espécies autótones. Este lagostim exótico, tem contribuído para o desaparecimento do Lagostim-de-patas-brancas (Austropotamobius pallipes), espécie nativa portuguesa.